Com o fracasso econômico das capitanias e o aumento das investidas estrangeiras na colônia, Portugal resolveu impor-se para assumir o controle efetivo da administração. Em 1548 surgia o Governo-Geral, com capital em Salvador.
A idéia era impor uma centralização política, o que funcionou na esfera militar, mas não se refletiu no dia a dia, em razão da falta infraestrutura de transporte e comunicação.
