Na verdade seria as bactérias que teria originado as mitocôndrias, no qual um uma bactéria teria se associado a um célula eucariota por mutualismo. Com a evolução essas bactéria passou a fazer parte da estrutura da célula . Uma das bases dessa hipótese é que o material genético da mitocôndria se difere das demais célula, e o material genético parece com a do da bactéria .