As divergências se deram pelo tipo de governo que Bolívar e San Martin imaginavam como o ideal para a região depois que a Independência fosse conquistada.
Para Bolívar, era necessário que se formasse um Estado forte, que concentrasse a maior parte dos antigos territórios coloniais por meio de um governo centralizado, uma forma de conseguir aproximação econômica. San Martin, por sua vez, defendia que deveria haver autonomia política para as antigas regiões coloniais, de modo que cada região se tornasse um país autônimo, por vezes com a divisão daquilo que era um único Vice-Reino Colonial em diversos países.
