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As moléculas são formadas pela união ou interação entre vários átomos, como por exemplo a molécula de água (dois átomos de hidrogênio e um de oxigênio).
A complexidade das moléculas formam as substâncias, as quais são encontradas na natureza em formas mais complexas, como por exemplo, as macromoléculas (lipideos, proteínas, ácidos nucleicos e carboidratos), as quais apresentam ligações mais dinâmicas.