As missões eram aldeamentos indígenas organizados pelos padres jesuítas, ali ocorria o processo de aculturação dos indígenas:
- eram catequizados, combatendo costumes e tradições indígenas que se chocavam com o cristianismo, como a antropofagia, a poligamia, a nudez, a crença nos rituais dos pajés etc.
- aprendiam ofícios e costumes da cultura européia,
- nas missões do norte, os jesuítas faziam com que trabalhassem na extração de drogas do sertão.