O conteúdo está bem resumido, para uma resposta mais aprofundada procure mais informações à respeito destes processos.
As substâncias que adentram a célula permanecem em uma vesícula (vacúolo alimentar). O lisossomo (organela responsável pela digestão intracelular) se funde com o vacúolo alimentar, e forma o que é conhecido como lisossomo secundário ou vacúolo digestivo. Ali sofre ação de enzimas digestivas e são digeridos. As substâncias maiores (macromoléculas) são hidrolisadas, formando pequenas moléculas que atravessam a membrana do vacúolo digestivo e chagam ao hialoplasma. Após esse processo, sobram no vacúolo moléculas não-assimiladas, passando a se chamar corpo residual. Esse corpo residual se funde à membrana plasmática e elimina seu conteúdo para o meio extracelular, o que é conhecido como clasmocitose ou defecação celular.