Alternativa A.
O garoto compreendeu. O garoto precisa estudar.
Como o pronome relativo é a substituição de uma expressão já utilizada, logo, o "que" da primeira exerce a função.
Veja como fica nas outras:
b) O garoto que estuda não se aborrece com a prova. (Ou: Quem estuda não se aborrece com a prova.)
c) O garoto sabia (o que?) que o conteúdo da prova era difícil.
